在东京都米花町的街道上，活跃着一支由小学生组成的特殊队伍，他们便是江户川柯南身边的少年侦探团。其固定成员包括：拥有高中生灵魂却缩水成一年级小学生的江户川柯南；好奇心旺盛、行动力超强的团长小岛元太；热爱科学、知识丰富的圆谷光彦；以及聪慧可爱、善良体贴的吉田步美。此外，博士阿笠博士是他们的技术顾问与监护人，而灰原哀（宫野志保）的后期加入，则为团队带来了冷静的头脑与深厚的科研背景。
这群孩子因对谜题与冒险的共同热爱而集结。元太常以团长自居，虽有时想法简单，却充满正义感与保护同伴的勇气；光彦善于观察与逻辑推理，是团队里的“理论派”；步美则以其细腻的情感，时常关注到被忽略的细节与人情，是团队的凝聚力所在。而核心柯南与灰原，则在暗中引导着调查方向，并确保伙伴们的安全。他们的组合并非完美无缺——时常有鲁莽行事、陷入险境的时候，但也正因这份纯真的热情与无畏，往往能误打误撞地触及成人忽视的盲点，成为破解案件的关键。
他们的活动基地常在阿笠博士家，有时也会在放学后的空教室集合，兴奋地讨论着遇到的谜题。元太曾挥舞着拳头，大声提议：“我们又发现了一个奇怪的事件，这次也一定要解开！去我们的侦探吧！”这个他口中的“侦探吧”，可能是公园的长椅，可能是街角的小店，任何能让他们聚首讨论的地方，都承载着他们对“侦探”梦想的实践。尽管大人们，尤其是目暮警官，时常为他们的涉险而头疼，但不得不承认，这些孩子已经多次在关键时刻提供了决定性的线索。
少年侦探团的日常，交织着平凡的校园生活与不平凡的冒险。他们之间有着最纯粹的友谊，会为一块蛋糕开心，也会为朋友的安危奋不顾身。在柯南追寻黑暗组织的主线之外，这群孩子代表了光明与希望的一面。他们的存在，让柯南在背负沉重秘密的同时，也能触摸到真实的童年温度。每一次齐心协力的推理，每一次成功破案后的击掌，都让“少年侦探团”这个名字，不仅仅是一个称号，更是他们共同成长、守护正义的宝贵见证。