关于名侦探柯南中黑暗组织的出场集数，一直是粉丝们热衷梳理和讨论的话题。这个神秘而危险的组织贯穿主线，其成员的出现往往预示着关键剧情的发展。由于剧集数量庞大且包含电视动画、剧场版、特别篇等不同形式，以下列举部分具有代表性的黑暗组织出场主要剧集，以供参考。
早期的重要登场包括《云霄飞车杀人事件》（TV 1），这是工藤新一变为江户川柯南的起点，琴酒和伏特加首次现身。《钢琴奏鸣曲〈月光〉杀人事件》虽非直接出场，但提及了宫野志保（灰原哀）的家族关联。随后的《黑衣组织10亿元抢劫事件》（TV 128）揭示了宫野明美的故事。而《与黑衣组织的再会》（TV 176-178）则是灰原哀身份暴露后与组织的正面交锋，皮斯科登场。
进入红与黑的主线对决，《黑色冲击！组织的魔爪伸来的瞬间》（TV 425）中水无怜奈（基尔）登场，涉及组织暗杀任务。《红与黑的碰撞》系列（TV 491-504）则围绕水无怜奈展开，深入刻画了FBI与组织的较量。《侦探们的夜想曲》（TV 671-674）中安室透（波本）首次登场，其真实身份此后引发长期悬念。《绯色系列》（TV 779-783）揭晓了冲矢昴、安室透与赤井秀一的复杂关系，并涉及组织二号人物朗姆的线索。
近期关键剧集包括《背叛的舞台》（TV 881-882），揭露了羽田浩司案与朗姆的关联。《寻找玛丽亚！》系列（TV 942-945）则进一步推进朗姆的调查。而《警察学校篇》虽为回忆，补充了降谷零（安室透）的过往。随着朗姆身份在《剑道大赛》等剧集逐步揭晓，主线已进入最终篇章的高潮阶段。
除了电视动画，多部剧场版如《通往天国的倒计时》、《纯黑的噩梦》和《黑铁的鱼影》也都是组织相关的重要作品。在侦探吧等爱好者聚集地，粉丝们常对这些剧集进行深入解析，梳理时间线与人物关系，试图拼凑出组织全貌。黑暗组织的出场集数分散而隐秘，正是这种若隐若现的威胁感，构成了《名侦探柯南》最扣人心弦的主线脉络，吸引着观众跟随柯南一步步逼近真相的核心。